幌延深地層研究計画は、「地上からの調査研究段階（第1段階）」、「坑道掘削（地下施設建設）時の調査研究段階（第2段階）」、「地下施設での調査研究段階（第3段階）」の3つの段階に分けて進めることとしています。
現在は、研究所用地やその周辺において、地下施設の建設、第2段階および第3段階の調査研究を行っています。
このページでは、地下施設整備の管理状況をご紹介します。
| 日 量 | 当月積算量 | 備 考 |
| 0ｍ3 | 5,357m3 |
*掘削土（ズリ）置場浸出水調整池からの排水も含む。
（水質調査結果「天塩川への排水量」ページ）
| 測定箇所 | 1号機 | 2号機 |
| ほう素 管理基準目標値5mg/l |
排水処理なし | 排水処理なし |
| アンモニア性窒素 管理基準目標値20mg/l |
排水処理なし | 排水処理なし |
（水質調査結果「排水処理設備の処理水の日常管理」ページ）
